Las aguas subterráneas, por su parte, son aquellas que se encuentran en las rocas del suelo (horizontes minerales: R…). Representan aproximadamente el 20% de los recursos hídricos españoles y constituyen aproximadamente un tercio del agua total utilizada en el país.
Muchos están relacionados con humedales, porque los alimentan. Unos 54 de los 75 humedales españoles de importancia internacional (Ramsar) dependen de las aguas subterránea, destacando
- Albufera de Valencia
- Aiguamolls de l’Empordà
- Tablas de Daimiel
- Doñana
- Delta del Ebro
- Fuente de Piedra
- Gallocanta
- Lagunas de Ruidera
- Mar Menor
Principales características de los acuíferos españoles
Las principales características de los acuíferos españoles son las siguientes:
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Extensos: unos 400 sistemas de acuíferos principales (más del 90% del territorio)
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Importantes: abastecen a aproximadamente al 15% de la población, además de alimentar espacios naturales importantes como Doñana, las Tablas de Daimiel o el Mar Menor
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Numerosos: Hay más de 800 masas de agua subterránea en España
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Geología: detríticos, carbonatados, volcánicos
| Tipología | Características |
|---|---|
| Detríticos | - materiales sueltos (gravas, arenas y limos) - uy permeables y porosos - bicados en fondos de valle de ríos importantes y grandes mesetas. - unos 99,000 km² - sos: abastecimiento, industria y agricultura de regadío |
| Carbonatados | - Rocas calizas y dolomíticas - Especialmente en el Este y Sur peninsular y Baleares - Importantes redes kársticas: infiltración rápida del agua y creación de manantiales - os 69,000 km² de extensión |
| Volcánicos | - Islas Canarias - Algunas zonas volcánicas del interior peninsular - Importantes reservas de agua en las rocas |
- Fauna estigobia: especializada de alto valor evolutivo, incluyendo peces troglobios, crustáceos, anélidos, y otros invertebrados.

Los principales acuíferos se ubican en las cuencas hidrográficas del Ebro (105 masas de agua), Júcar (90), Duero (64) y Segura (63). Otros importantes incluyen los de las cuencas del Guadiana y Guadalquivir
- Ebro (105 masas de agua)
- Júcar (90)
- Duero (64)
- Segura (63)
- Otros: cuencas del Guadiana y Guadalquivir
Aproximadamente el 44% de las masas de agua subterránea están en mal estado, con problemas graves.
Principales problemas de conservación en relación con la diversidad biológica
Los principales problemas de conservación relacionados con la diversidad biológica en los acuíferos españoles se deben principalmente a la sobreexplotación y la degradación del recurso hídrico.
| Principales problemas de conservación | Impactos |
|---|---|
| Sobreexplotación y descenso del nivel freático | Extracción excesiva para usos agrícolas, industriales y urbanos reduce los niveles piezométricos - Desecaciones: humedales, manantiales, y ecosistemas hiporreicos - Pérdida de hábitat para especies estigobiontes (organismos exclusivos del medio subterráneo) - Ruptura de la conectividad hidrológica entre ecosistemas superficiales y subterráneos |
| Contaminación difusa | - Nitratos y fosfatos: de agricultura intensiva, causando eutrofización en afloramientos - Plaguicidas y herbicidas: por uso agrario, afectando por toxicidad directa a la fauna acuática - Metales pesados: por minería e industria, con bioacumulación en cadenas tróficas - Fármacos y disruptores endocrinos: por aguas residuales, con alteraciones reproductivas en la fauna - Hidrocarburos: por vertidos industriales, generando anoxia y destrucción de la biocenosis. |
| Alteración del régimen térmico | El cambio climático y la urbanización (efecto isla de calor), afectan a las especies estenotérmicas (adaptadas a condiciones constantes), a determinados procesos bioquímicos (nitrificación, desnitrificación…) |
| Intrusión salina | Por sobreeplotación en zonas costeras, lo que destruye hábitats subterráneos de la zona de mezcla (anquialinos), altera las comunidades de macroinvertebrados, y elimina condiciones para especies endémicas. |
| Desconexión del continuo acuático | - Barreras hidrográficas (presas, canalizaciones, sellado del suelo), que interrumpen la recarga natural y la conectividad, fragmentando poblaciones de peces migradores, anfibios… |
| Especies invasoras y patógenos | - Batrachochytrium dendrobatidis - Gambusia - Cangrejo rojo americano… |
| Vacíos normativos y de conocimiento | - Escasa representación de ecosistemas subterráneos en figuras de protección (muy pocos acuíferos tienen estatus legal de protección), - Ausencia de índices bióticos estandarizados para evaluar el estado ecológico de los acuíferos, dificultad de monitoreo… |